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Quick Cell探針法支原體檢測試劑盒

簡(jian)要描述:《Quick Cell探針(zhen)法支(zhi)原(yuan)體(ti)檢測(ce)試劑盒》采用支(zhi)原(yuan)體(ti)特異性引物和支(zhi)原(yuan)體(ti)特異性熒光探針(zhen)(報(bao)告(gao)基因為FAM),用于(yu)對樣品的支(zhi)原(yuan)體(ti)基因組DNA進行熒光定量PCR擴增檢測(ce)。可用于(yu)檢測(ce)一切(qie)可能含支(zhi)原(yuan)體(ti)的樣品,比如:體(ti)外(wai)細胞(bao)培養(yang)的上(shang)清、血清、各(ge)種(zhong)體(ti)液(ye)(ye)(如唾液(ye)(ye)、尿液(ye)(ye)、鼻腔分泌物)、別的液(ye)(ye)體(ti)樣品。

  • 產品型號(hao):AC16L068
  • 廠商性質:生產廠家
  • 更(geng)新時間:2024-04-18
  • 訪  問  量(liang):1190

詳細介紹

品牌其他品牌貨號AC16L068
供貨周期現貨應用領域生物產業

Quick Cell探針法(fa)支原(yuan)體(ti)(ti)檢(jian)測(ce)試劑(ji)盒

產品描述(shu)

Quick Cell探針法支原體檢測試劑盒(Quick Cell qPCR Mycoplasma Detection Kit with Probe)采用支原體特異性引物和支原體特異性熒光探針(報告基因為FAM),用于對樣品的支原體基因組DNA進行熒光定量PCR擴增檢測。試劑盒內同時含有內參對照質粒mycoIC2和相應的引物和熒光探針(報告基因為VIC),用于監控支原體DNA提取和qPCR擴增的效率。本試劑盒可用于檢測一切可能含支原體的樣品,比如:體外細胞培養的上清、血清、各種體液(如唾液、尿液、鼻腔分泌物)、別的液體樣品。

經多次測試,本試劑盒有記錄可以識別在體外細胞培養中曾經報道出現的20種支原體。根據文獻報道,這些支原體基本上占污染細胞的支原體種類的100%。具體如下:(1M. hyorhinis、(2M. fermentans、(3M. arginini、(4M. hominis、(5M. orale、(6M. salivarium、(7M.pirum、(8A. laidlawii、(9M. agalactiae、(10M. bovis(11) M. bovoculi、(12A. axanthum、(13M. buccale (14) M. pneumoniae、(15M. arthritidis、(16M. pulmonis、(17M. gallisepticum、(18M. gallinarum、(19M. canis、(20Ureaplasma urealyticumM.Mycoplasma的縮寫;A.Acholeplasma的縮寫)。

訂(ding)購信息

產品名稱(cheng)

產(chan)品貨號(hao)

規格

Quick Cell探針法支(zhi)原(yuan)體檢測試(shi)劑(ji)盒(he)

AC16L068

50T

產品組分

產品組分

規格

探針法溶液1P50T

550   μL,含支原體和內參檢測用引物及熒光探針

探針法溶液2T50T

 

 

50 μL,酶溶液

內參質粒mycoIC2

500   μL

去離子水

1.2   mL

陽性支原體DNA

50 μL

注:①本試劑盒由于含有內參質粒mycoIC2(用于監控支原體DNA提取和qPCR擴增的有效性),客戶可以選擇進行樣品支原體DNA的提取(內參質粒mycoIC2在支原體DNA提取過程中加入),也可以選擇不進行樣品支原體DNA的提取(內參質粒mycoIC2在配制體系時加入)。

②本試劑盒的配套儀器可以是任何具有FAMVIC檢測通道的熒光定量PCR儀。

運輸與保存

藍冰運輸。-20℃避光保存,有效期60個月。

使用方(fang)法

1.       待測樣品的前(qian)處理

為了準確判斷細胞是否有支原體的污染,待測的細胞培養液樣品需要取自換液后培養2-3d且匯合度在90%左右的細胞培養液上清(貼壁細胞)。懸浮培養的細胞也需要在換液傳代后,讓細胞生長2-3d再取培養液進行檢測。可以按照以下兩種方法之一進行樣品的前處理:

1.1 方法一:對樣品進行支原體DNA的提取

很多樣品(比如:培養很多天的細胞上清、血清、血漿等)由于含有抑制PCR擴增的成分,如果樣品不進行前處理而直接檢測,有可能導致qPCR擴增失敗(qPCR結果:支原體通道和內參對照通道均無擴增曲線)。該類樣品建議客戶進行樣品DNA提取(或者離心清洗,見后文方法二)后,再進行檢測。提取DNA的過程有兩個作用:(1)  基本可以去除所有抑制PCR擴增的成分,保證后續定量PCR擴增的正常進行;(2)具有濃縮支原體DNA的作用,可以提高相對檢測靈敏度10-100倍。

1.2  方法二:樣品不經DNA提取

推薦此方法。該方法不僅可以濃縮支原體從而提高相對檢測靈敏度,還可以去除絕大部分可能的抑制物,PCR擴增被抑制的可能性極低。如果該簡單一步離心清洗的方法仍然無法去除抑制物,可以使用后文注意事項部分的三步離心清洗的方法。具體方法如下:

(1)  根據濃縮倍數,可以取100 - 1500 μL上述待測樣品到1.5 mL離心管內,在普通臺式離心機上1000 rpm (大約150 g)低速離心5 min,將離心后的上清轉移到另一個離心管內,丟棄細胞沉淀。

(2)  將上清繼續13000 rpm(約16000 g)高速離心10 min,小心吸走全部上清(為避免碰到底部沉淀,可以保留底部3-5 μL液體),用50μL 5 mM Tris-HCl, pH 8.0-8.8(樣品可以長期保存)或者去離子水(樣品比較不穩定,只適合當天或短期內檢測使用)重懸沉淀(沉淀中含有支原體),吹吸均勻(如果最初使用了1500 μL的樣品,則支原體濃度大約提高了30倍)。

(3)  至此,該樣品可以直接進行檢測,也可以進行熱處理后再檢測(熱處理后,樣品保存更穩定)。熱處理具體如下:95 ℃加熱處理5 min(可以轉移到PCR管內,在PCR儀上進行加熱處理),簡單離心(1000 g5 sec)后,取上清進行檢測。

1:這里的細胞培養上清不是指細胞經胰*消化后的離心上清,而是指至少培養2d后的貼壁細胞培養液上清(不需要胰*消化,也不能取經胰*消化后的離心上清進行檢測)或懸浮細胞培養液。

2:本步驟的低速離心是為了去除哺乳動物細胞,以排除其不必要的干擾。所以離心力要嚴格控制在150-200 g,該離心力下,哺乳動物細胞將被沉淀下來而支原體不會。如果錯誤使用更高的離心力將可能導致支原體也被離心下來,從而導致假陰性。

3:收集的待測細胞培養液樣品如果不立即檢測,請放于-20℃或-80℃冰箱保存,不得放于室溫或4℃冰箱。樣品在-20℃至少可以保存一個月,在-80℃可以長期保存。此外,為了節約檢測成本,可以將不同時間收集的樣品放于-20℃或-80℃冰箱保存,而后一起檢測。

2.       熒光定量PCR體系的配制

本步驟所有操作強烈建議使用進口濾芯吸頭(比如Axygen濾芯吸頭)進行操作,以避免試劑被污染。操作之前,請認真看完后文的注意事項后,再進行操作:

將探針法溶液1P、陽性支原體DNA、去離子水、內參質粒mycoIC2-20 ℃冰箱中取出,放室溫融化(也可以用手握住幫助融化)。探針法溶液1P和探針法溶液2T開蓋之前,請高速離心一下(5000 rpm,離心1min)。探針法溶液2T不能在室溫長久放置(可以短時間放置5-10min),建議在-20 ℃冰箱直接吸取。

如果樣品總數為NN=待測樣品數+1個陽性對照+1個陰性對照),待測樣品的前處理方法不同,對應的反應體系也不同,具體如下:

2.1樣品進行DNA提取后的反應體系

DNA提取過程中,必須按說明書加入內參質粒mycoIC2。如果提取時沒有加入內參質粒mycoIC2,則按照后文“樣品不經DNA提取的反應體系"進行操作:

(1)  反應體系:

1. 樣品經DNA提取后的反應體系


單個樣品體積(μL)

樣(yang)品總數

總體積(μL)

探針法溶液1P

11

N

11×N×1.06

探針法溶液2T

1

N

1×N×1.06

注:總體積中多配制6%(該比例如果覺得不合適,可以自己調整),是為了防止移液誤差,以保證每個反應管中的反應液足量。

例:如果待測樣品為8個(加上1個陰性和1個陽性對照),則樣品總數為10個。探針法溶液1P的總體積為11×10×1.06=116.6 μL,探針法溶液2T的總體積為1×10×1.06=10.6 μL

(2)  將上述2種溶液混合,吹打均勻后,按每管12 μL分裝到熒光定量PCR八聯管中。

(3)  待測樣品管加入18 μL提取好的待測樣品DNA(樣品DNA加入量不能減少,否則內參質粒擴增可能失敗);陰性對照管加入2 μL內參質粒mycoIC2(吹吸均勻后加入)和16 μL去離子水(為防止去離子水被污染,此處建議使用20 μL移液槍配合200 μL吸頭進行吸取操作);陽性對照管加入2 μL陽性支原體DNA(吹吸均勻后加入)和16 μL去離子水。每管反應液的總體積為30 μL

2.2 樣品不經DNA提取的反應體系:

(1)  反應體(ti)系:

3. 內參質粒mycoIC2統一在配制PCR反應體系時加入


單個樣品體積(μL)

樣品總(zong)數

總體積(μL)

去離子水(shui)

14

N

14×N×1.06

探針法溶液1P

11

N

11×N×1.06

探針法溶液2T

1

N

1×N×1.06

內參質粒mycoIC2

2

N

2×N×1.06

注:總體積中多配制6%(該比例如果覺得不合適,可以自己調整),是為了防止移液誤差,以保證每個反應管中的反應液足量。

例:如果待測樣品為8個(加上1個陰性和1個陽性對照),則樣品總數為10個。去離子水的總體積為14×10×1.06=148.4 μL,探針法溶液1P的總體積為11×10×1.06=116.6 μL,探針法溶液2T的總體積為1×10×1.06=10.6 μL,內參質粒mycoIC2的總體積為2×10×1.06=21.2 μL

(2)  將上述3種溶液混合,吹打均勻后,按每管28  μL分裝到熒光定量PCR八聯管中。

(3)  待測樣品管加入2 μL待測樣品DNA,陰性對照管加入2 μL去離子水,陽性對照管加入2 μL陽性支原體DNA(吹吸均勻后加入)。每管反應液的總體積為30 μL

(4)  蓋上熒光定量PCR八聯管蓋子,去除反應管中的大氣泡,3000-6000 rpm離心30 sec

注:定量PCR八聯管的封蓋,應該佩戴全新的PE手套進行操作,避免裸手接觸定量PCR八聯管。

3.       實時熒光定量PCR擴增:

PCR八聯管放入熒光定量PCR儀內,設置如下實時熒光定量PCR擴增程序:

3. 熒光定量PCR擴增程序

步驟

作用

循(xun)環數

溫(wen)度

時間

收集熒光信號(hao)

1

預變性

1 cycle

95 ℃

2 min

否(No

2

預(yu)擴增

(不收集熒光)

5 cycles

95 ℃

10 sec

否(No

60 ℃

35 sec

否(No

3

正(zheng)式擴增

(需要收集熒光(guang))

40 cycles

95 ℃

10 sec

否(No

60 ℃

35 sec

是(Yes

注:支原體檢測熒光通道選擇FAMReporter: FAMQuencher: None);內參對照檢測熒光通道選擇VICReporter: VIC, Quencher: None);反應體積(Sample Volume)為30 μL;參考熒光(Passive Reference,只有ABI儀器需要設置)選擇None

4.       結果分析:

4.1 ABI StepOne Plus 熒光定量PCR儀基線和閾值設定方法

其他熒光定量PCR儀的設置大同小異,請參考各自儀器說明書進行設置。

(1)  基線(Baseline)的設定:可以將Auto baseline前面的去掉,然后手動設置基線的起點為2(將剛開始熒光值不穩定的幾個循環排除在基線之外。如果起點2不合適,可以適當增減),終點為10左右。

(2)  閾值(Threshold)線的設定:不同通道的閾值應該分別設定。設定某個通道閾值線時,首先選中含陰性對照的若干個樣品,去掉儀器勾選的自動Threshold線,將其選項Auto"改為  Auto",然后手動調整閾值線,以閾值線剛好超過正常陰性對照FAM通道擴增曲線(無規則噪音線)的最高點為準。

4.2 實驗(yan)有效性判斷:

陽性對照管:其FAM通道有典型的S型擴增曲線(即指數擴增),其VIC通道的擴增線呈直線或者S型曲線。

陰性對照管:其FAM通道的擴增線呈直線,其VIC通道應該有典型的S型擴增曲線。

如果陽性對(dui)照管、陰性對(dui)照管同時滿足上述條件,則說明本次實(shi)(shi)驗(yan)結(jie)果有效,否(fou)則實(shi)(shi)驗(yan)結(jie)果無(wu)效。

典型的陰性直線型擴增線和陽性S型擴增曲線如圖1所示:

                                              image.png

1. 典型的陰性直線型擴增線(左)和陽性S型擴增曲線(右)

 

4.3 待測樣品結果(guo)判斷:

待測樣品有可能出現以下4種組合:

4. 待測樣品管FAM通道和VIC通道可能組合

組合

FAM通道(測(ce)支原體(ti))

VIC通道(測內參)

支(zhi)原體污染判斷

1

S型曲線

S型曲線(xian)

支(zhi)原體污染

2

S型曲線(xian)

直(zhi)線

支原體污(wu)染

3

直線

S型曲線

無支(zhi)原體

4

直線

直線

PCR被(bei)抑(yi)制(zhi),結(jie)果(guo)無效

待測樣品管只要FAM通道有S型擴增曲線(組合1和組合2)就說明有支原體污染。因為外加的內參質粒mycoIC2分子數極少,如果支原體含量很大時,內參質粒的擴增會被抑制,導致內參VIC通道無信號(組合2)。

如果待測樣品管FAM通道呈直線,而VIC通道有S型曲線(說明樣品的DNA提取過程和PCR擴增過程均正常)(由于提取過程中,外加的內參質粒mycoIC2分子數較少,作為內參對照的VIC通道的Ct值會比較大),說明樣品無支原體。

如果陽性對照管和陰性對照管結果正常,而待測樣品管FAM通道和VIC通道均呈直線,說明PCR被抑制。如果樣品是經過提取的,最可能原因是:DNA洗脫前,吸附膜中的乙醇沒有揮發(解決方法:洗脫前,將吸附柱放50-65℃烘箱至少15min)。如果樣品是沒有經過提取的,則樣品本身含有抑制PCR的成分(解決方法:將樣品進行DNA提取或者離心清洗)。

1:陽性結果需要結合擴增曲線(主要)和Ct值(次要)進行判斷,不能只看Ct值(因熒光值的波動,個別陰性樣品雖然擴增曲線基本呈直線,但可能會出現Ct值,此類樣品不能判斷為陽性。反之亦然:有些樣品有S型曲線,但是因為熒光值波動,導致沒有Ct值,此類樣品不能判斷為陰性)

2:無論FAM通道,還是VIC通道,只要其擴增曲線有明顯抬升(呈現S型曲線趨勢),即使其Ct值在35-40范圍內,該檢測結果仍可判斷為陽性,可以報告該Ct值。

3:結果判斷完后,將PCR八聯管用自封袋密閉后,進行適當處理。

注意(yi)事項

1.         本產品主要用于(yu)細胞(bao)上清支原體(ti)污染檢測(ce),僅限(xian)于(yu)科學實驗研究使用,不得用于(yu)臨床診斷、治療(liao)等(deng)領域。

2.         DNA污染注意事項:

(1)  強烈建議所有操作(特別是qPCR體系配制步驟和吸取試劑盒中試劑的時候)使用濾芯吸頭進行操作,以免試劑被污染。

(2)  必(bi)須確保使用的(de)移液槍本身(shen)沒(mei)有(you)殘(can)留的(de)支原體。

(3)  樣品前處理的各類吸頭、離心管,以及吸取陽性對照DNA、待測樣品DNA的吸頭,務必小心處理,請將其裝入含有半瓶水的帶蓋的、可密封的瓶子內,全部樣品吸取完后,蓋上瓶蓋,以防止陽性DNA的揮發,造成環境的污染,進而造成假陽性。整個操作過程,最好不要說話,因為人的口腔和唾液都是帶支原體的。

(4)  反(fan)應后,請勿打開反(fan)應管(guan)的(de)蓋(gai)子,否則有可能造成檢測(ce)環境(jing)的(de)污染。結果判斷完后,將其(qi)用自封袋密閉后,進行(xing)適當處理。

3.         實驗室必須嚴(yan)格分(fen)房間(jian)(jian)操(cao)(cao)作(zuo)(zuo)(zuo)(本(ben)試劑盒(he)建議在有(you)窗(chuang)戶、通風良好的普(pu)通房間(jian)(jian)內操(cao)(cao)作(zuo)(zuo)(zuo),請(qing)勿在密(mi)閉的房間(jian)(jian)操(cao)(cao)作(zuo)(zuo)(zuo)。請(qing)勿在細胞培養間(jian)(jian)進行該步(bu)驟(zou)的操(cao)(cao)作(zuo)(zuo)(zuo),因為細胞培養間(jian)(jian)支(zhi)原體(ti)污染概率很(hen)高):

試劑配制房間1:專門進行定量PCR體系的配制(建議該房間全部使用進口濾芯吸頭。)

DNA提取房間2:專門進行支原體DNA的提取;

DNA加樣房間3:專門進行定量PCR體系配制后,添加待測樣品、陽性對照、陰性對照等操作;

PCR擴增房間4:進行實時熒光PCR擴增檢測。

注:如果房間緊張,可以考慮將房間2、房間3合并在一個房間,而房間1和房間4必須獨立。各房間物品(包括移液槍)均為專用,不得交叉使用。

4.         如果出現qPCR的擴增被細胞的代謝產物抑制時(qPCR結果:支原體通道和內參對照通道均無擴增曲線),可以采取以下幾種措施:

(1)  將取樣的時間提前到換液后2 d3 d,此時細胞上清的PCR擴增抑制物相對比較少,一般不會產生嚴重的抑制。據我們測試,換液后5 dPCR擴增抑制物就已經大量積累。

(2)  PBS對待測樣品進行離心清洗,去除樣品中的抑制物。具體方法如下:取1 mL細胞上清,先13000 rpm離心10 min,吸走950 μL上清;加PBS 950 μL,再次離心,吸走950 μL上清;再加PBS 950 μL,第三次離心,小心吸走全部上清(為避免碰到底部沉淀,可以保留底部3-5 μL液體),用50 μL 5 mM Tris-HCl, pH 8.0-8.8 重懸沉淀,95 ℃加熱處理5 min,簡單離心(1000 g5 sec)后,取上清進行檢測。但是該方法有如下缺點:第一,如果樣品支原體含量較少,離心清洗可能導致漏檢,因為離心清洗過程中,可能導致支原體部分丟失。第二,個別樣品,即使經過上述清洗也無法去除抑制劑。

(3)  抽提細胞上清的支原體DNA后再進行PCR鑒定。

(4)  使用李記生物的Quick Cell支原體快速檢測試劑盒(細胞培養專用)(貨號:AC16L061或者Quick Cell 發光法支原體檢測試劑盒(貨號:AC16L062進行檢測,經測試,未發現這兩種試劑盒會被細胞的代謝產物所抑制。為了預防PCR的擴增被細胞的代謝產物抑制的問題,也可以考慮將所有待測樣品全部進行離心清洗或者DNA提取后,再使用本試劑盒進行檢測。

5.         支原體檢測樣品可以分成兩類:第一類,用含血清的培養液培養的哺乳動物細胞上清液,由于該條件非常適合支原體生長,培養數天后,支原體密度一般較高,可達107-9/mL,可以直接檢測。第二類,低溫保存的血漿、血清、臍帶血、胰*、抗生素、未使用的培養液等樣品,由于這些樣品即使有支原體污染,支原體含量一般很少,直接使用快速支原體檢測試劑盒進行檢測,往往檢測不出來。這些樣品建議:(1)對樣品的支原體進行離心濃縮將支原體DNA濃縮提取,該兩種方法大約可以將檢測靈敏度繼續提高10-100倍。該方法速度快,當天出結果,但是可靠性不如后面的培養法。(2)使用支原體液體培養基(必須同時接種不含精*酸和含精*酸的兩種支原體液體培養基)培養3-7 d后,再進行檢測。具體方法請參考李記生物Quick Cell 發光法支原體檢測試劑盒(貨號:AC16L062說明書中最后的注意事項部分。該方法速度較慢,需要3-7 d,但是可靠性高。

6.         如何提高本試劑盒檢測靈敏度:如果預期待測樣品支原體含量較少(比如,低溫保存的血清、臍帶血、胰*、抗生素、未使用的培養液、生物制品、極個別細胞培養上清等),可以采取以下幾種措施:(1)將支原體DNA濃縮提取后再進行檢測(提取過程還可以把所有可能的PCR抑制劑全部去除),大約可以將檢測靈敏度提高10-100倍。(2)對支原體進行離心濃縮:取1 mL細胞上清,先13000 rpm(約16000 g)離心10 min,吸走全部上清,用50 μL 5 mM Tris-HCl, pH 8.0-8.8 重懸沉淀,95 ℃加熱處理5 min,簡單離心后(1000 g5 sec),取上清進行檢測。該離心濃縮過程大約可以將檢測靈敏度提高20倍。(3)如果樣品是未經提取的,可以通過增加反應管中樣品DNA的加入量,比如由原來的2 μL增加到18 μL,如此可以提高檢測靈敏度9倍(沒有提取純化或者離心清洗的待測樣品,一般不能直接擴大待測樣品體積,否則PCR被抑制的可能性將大幅度增加。)

7.         如發現細胞被支原體污染,推薦使用李記生物的Quick Cell支原體祛除預防試劑盒(貨號:AC16L066EZ 水浴鍋抑菌劑(貨號:AC16L162EZ 細胞房除菌劑(貨號:AC16L143。產品詳情可咨銷或見官。

 

 

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